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J.
R.
Lacadena,
J.
A.
Esteban,
B.
de
Pascual

El
trabajo
pionero
en
esta
área
se
debe
a
Warshel
y
Levitt.(1)
En
este

trabajo,
los
investigadores
presentaban
por
primera
vez
la
combinación
de
ambos

métodos
para
describir
la
formación
de
un
intermedio
de
tipo
ión
carbonio
en
el

sitio
activo
de
la
lisozima.

Esta
técnica
permite
combinar
potenciales
de
la
mecánica
cuántica
(QM)
y

de
la
mecánica
molecular
(MM)
en
un
potencial
híbrido
QM/MM.

Permite
combinar
la
simplicidad
y
velocidad
del
tratamiento
MM
con
el

potencial
de
la
QM
que
permite
el
estudio
de
la
formación
y
ruptura
de
enlaces,
así

como
la
inclusión
de
la
polarización
electrónica
debida
al
medio.
Este
tipo
de

aproximación
nos
va
a
permitir
el
estudio
de
reacciones
químicas
en
el
seno
de

grandes
sistemas
ya
que
las
regiones
del
sistema
implicados
en
la
reacción
se

analizan
mediante
una
función
QM
mientras
que
el
potencial
de
los
demás
átomos

del
sistema
se
examina
por
cálculos
clásicos
de
MM
en
los
que
las
interacciones

atómicas
están
regidas
por
el
campo
de
fuerzas.

Figura
5.
Representación
de
la
división
de
un
sistema
molecular
en
zona
QM
y
zona
MM.

La
energía
total
(Etot)
para
este
tipo
de
sistemas
se
puede
escribir
de
la

siguiente
forma:

Etot
=
EQM
+
EMM
+
EQM
/
MM

donde
EQM
y
EMM
corresponden
a
la
energía
de
aquellas
partes
del
sistema

tratadas
exclusivamente
con
mecánica
cuántica
y
mecánica
molecular,

respectivamente.
Mientras
que
EQM/MM
es
la
energía
de
interacción
entre
las
partes

mecánicocuánticas
y
mecánico-­-moleculares.

Los
átomos
de
la
región
QM
se
representan
como
electrones
y
núcleos.
El

Hamiltoniano
asociado
a
esta
región,
en
la
aproximación
de
Born-­-Oppenheimer.

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