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J.
M.
ORTIZ
MELÓN

O104:H4,
identificado
en
2006
en
una
paciente
coreana.
En
la
actualidad
se
está

empleando
la
tipificación
mediante
electroforesis
en
campo
pulsado
y
MLST.

La
temperatura
óptima
de
crecimiento
de
los
ECEH
es
de
37
ºC,
pero

pueden
crecen
en
un
amplio
rango
de
temperaturas
y
soportar
un
pH
de
tan
solo

4,4.
Los
criterios
microbiológicos
para
la
confirmación
de
un
caso
por
ECEH

O104:H4,
incluyen
uno
de
estos
cuatro:
(i)
cultivo
del
patógeno
en
heces
y

detección
en
el
mismo
de
Stx2
por
ELISA,
(ii)
detección
por
PCR
del
gen
stx2
en
la

misma
muestra
donde
se
ha
identificado
el
patógeno
(incluso
en
cultivo
mixto),

(iii)
detección
de
IgM
anti-­-LPS
específica
de
serogrupo
(ELISA(WB)
y
(iv)

incremento
significativo
en
el
título
de
IgG
anti-­-LPS
específica
de
serogrupo

(ELISA)
en
dos
muestras
separadas.

Hay
pocos
datos
sobre
la
sensibilidad
a
los
antimicrobianos
de
los
ECHE.
La

cepa
actual
O104:H4
produce
la
beta-­-lactamasa
de
espectro
extendido
CTX-­-M-­-15
y

TEM-­-1
y
además,
es
resistente
a
estreptomicina,
tetraciclina
y
cotrimoxazol.

El
Dr.
D.
Juan
Maria
Garcia-­-Lobo,
Catedrático
de
Microbiologia,
expuso
cómo

el
abordaje
genómico
en
esta
epidemia
ha
dado
resultados
espectaculares
y
marca

un
nuevo
rumbo
para
el
procedimiento
a
seguir
ante
un
brote
infeccioso
en
el

futuro.

Así,
la
primera
información
pública
de
un
ensamblaje
preliminar
del

genoma
de
la
bacteria
causante
del
brote
se
tuvo
el
2
de
junio.
Los
primeros
datos

fueron
obtenidos
con
una
nueva
tecnología
(Ion
Torrent,
Life
Technologies)
que
es

rápida
y
económica,
aunque
las
secuencias
tienden
a
ser
cortas
y
de
calidad
media.

Estos
datos
se
completaron
en
las
semanas
siguientes
con
los
obtenidos
con

tecnología
mas
costosa
(Illumina,
Roche-­-454).
En
la
actualidad
(21
de
junio),

disponemos
de
secuencias
de
9
aislamientos
independientes.
Los
datos
de
mejor

calidad
que
han
permitido
ensamblajes
completos
más
rápidamente
han
sido
los

de
454-­-Roche.

Los
resultados
disponibles
indican
que
la
bacteria
responsable
del
brote

posee
un
genoma
consistente
en
un
cromosoma
circular
de
5.278.900
pb
y
tres

plásmidos.
La
comparación
de
los
cromosomas
muestra
que
todas
las
cepas

secuenciadas
son
esencialmente
idénticas
y
muestran
un
96%
de
sus
secuencias

casi
idénticas
a
las
de
un
aislamiento
ya
secuenciado
de
un
E.
coli
enteroagregativo

(EAEC),
Ec
55989,
causante
de
diarreas
y
aislado
en
la
Républica

Centroafricana.

Las
diferencias
más
significativas
entre
el
E.
coli
causante
del
brote
y

Ec55989
se
localizan
en
4
regiones
(islas)
que
aportan
250
kb.
La
más
notable
es

un
profago
portador
de
los
genes
de
la
toxina
Shiga
tipo
2.
Se
ha
identificado
otro

profago
aparentemente
sin
carga
y
dos
secuencias
con
propiedades
de
islas

génicas.
Una
de
ellas
contiene
numerosos
genes
de
resistencia
y
posibles

4