Page 19 - 79_04
P. 19

Óscar	
  Miguel	
  Rivera	
  Borroto	
  &	
  col.	
  

	
  
2.1.	
  Cribado	
  virtual	
  	
  

        El	
   cribado	
   virtual	
   (VS,	
   del	
   inglés	
   Virtual	
   Screening)	
   in	
   silico	
   consiste	
   en	
   el	
  
análisis	
   computacional	
   de	
   bases	
   de	
   datos	
   de	
   compuestos,	
   dirigido	
   a	
   identificar	
   y	
  
seleccionar	
   un	
   número	
   limitado	
   de	
   candidatos	
   que	
   posean	
   la	
   actividad	
   biológica	
  
deseada	
   sobre	
   un	
   blanco	
   terapéutico	
   específico	
   (19).	
   Este	
   paradigma	
   “más	
  
racional”	
   puede	
   verse	
   como	
   una	
   alternativa	
   al	
   cribado	
   de	
   alto	
   rendimiento	
   (HTS,	
  
del	
   inglés	
   High	
   Throughput	
   Screening)	
   con	
   las	
   ventajas	
   de	
   que	
   pueden	
   ser	
  
evaluadas	
   in	
   silico	
   cantidades	
   arbitrarias	
   de	
   moléculas	
   reales	
   o	
   virtuales	
   y	
   se	
  
pueden	
  ahorrar	
  como	
  promedio	
  140	
  millones	
  de	
  USD	
  y	
  0.9	
  años	
  por	
  cada	
  fármaco	
  
(20).	
   En	
   esencia,	
   los	
   enfoques	
   HTS	
   y	
   VS	
   poseen	
   una	
   naturaleza	
   complementaria	
  
entre	
   sí,	
   por	
   cuanto	
   se	
   han	
   introducido	
   varios	
   y	
   diversos	
   conceptos	
   y	
   métodos	
  
computacionales	
   para	
   analizar	
   datos	
   de	
   cribado	
   experimental,	
   extraer	
  
conocimiento	
  de	
  los	
  experimentos	
  HTS	
  y	
  derivar	
  modelos	
  predictivos	
  de	
  actividad	
  
(21).	
  

        En	
  la	
  práctica,	
  el	
  cribado	
  virtual	
  requiere	
  del	
  conocimiento	
  de	
  la	
  estructura	
  
del	
   blanco	
   terapéutico,	
   usualmente	
   obtenido	
   por	
   métodos	
   cristalográficos,	
   o	
   de	
   la	
  
actividad,	
   medida	
   experimentalmente,	
   en	
   un	
   conjunto	
   de	
   compuestos.	
   Si	
   la	
  
estructura	
   de	
   la	
   diana	
   farmacológica	
   es	
   conocida,	
   el	
   enfoque	
   más	
   común	
   para	
   el	
  
cribado	
  virtual	
  son	
  los	
  estudios	
  de	
  acoplamiento	
  o	
  “docking”,	
  los	
  que	
  consisten	
  en	
  
la	
   derivación	
   de	
   una	
   puntuación	
   o	
   “score”	
   de	
   la	
   actividad	
   a	
   partir	
   del	
  
posicionamiento	
   óptimo	
   del	
   ligando	
   en	
   el	
   sitio	
   activo	
   del	
   blanco	
   (6).	
   Este	
   enfoque	
  
de	
   cribado	
   virtual	
   suele	
   brindar	
   los	
   resultados	
   más	
   confiables	
   y	
   al	
   mismo	
   tiempo	
  
resulta	
  atractivo	
  por	
  el	
  gran	
  número	
  (alrededor	
  de	
  500)	
  de	
  dianas	
  farmacológicas	
  
disponibles	
  (ver	
  Figura	
  3).	
  	
  

Figura	
   3.-­-	
   Dianas	
   farmacológicas	
   distribuidas	
   en	
   siete	
   clases	
   bioquímicas	
   principales,	
   donde	
   las	
  
enzimas	
  y	
  receptores	
  representan	
  la	
  parte	
  mayoritaria.	
  	
  

        Si	
   se	
   desconoce	
   la	
   estructura	
   del	
   blanco,	
   los	
   métodos	
   de	
   cribado	
   virtual	
  
pueden	
  derivarse	
  de	
  un	
  grupo	
  de	
  compuestos	
  con	
  actividad	
  conocida	
  obtenidos	
  de	
  
ensayos	
   experimentales	
   previos.	
   Estos	
   métodos	
   se	
   conocen	
   como	
   enfoques	
   de	
  

536	
  

	
  
   14   15   16   17   18   19   20   21   22   23   24