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Perspectiva	
  general	
  sobre	
  el	
  proceso	
  de	
  desarrollo	
  de	
  fármacos…	
  

	
  
        Hasta	
   los	
   años	
   80,	
   el	
   paso	
   de	
   generación	
   de	
   hits	
   o	
   candidatos	
   potenciales	
  

(moléculas	
   que	
   muestran	
   una	
   determinada	
   actividad	
   química	
   pero	
   que	
   no	
  
necesariamente	
   cumplen	
   con	
   los	
   requerimientos	
   de	
   eficiencia	
   de	
   un	
   lead	
   o	
  
compuesto	
   líder)	
   constituía	
   el	
   principal	
   paso	
   limitante	
   del	
   proceso	
   de	
  
descubrimiento	
  y	
  desarrollo	
  de	
  nuevos	
  fármacos	
  (DDDP,	
  del	
  inglés	
  Drug	
  Discovery	
  
and	
   Development	
   Process)	
   debido	
   al	
   costo	
   de	
   la	
   síntesis	
   y	
   evaluación	
   de	
   nuevas	
  
moléculas	
   (10).	
   Durante	
   esta	
   etapa	
   las	
   esperanzas	
   de	
   resolver	
   el	
   problema	
   del	
  
DDDP	
  fueron	
  puestas	
  en	
  el	
  desarrollo	
  de	
  las	
  tecnologías	
  de	
  alto	
  rendimiento	
  (14)	
  y	
  
la	
   química	
   combinatoria	
   (15),	
   a	
   través	
   de	
   una	
   paralelización	
   masiva	
   del	
   proceso.	
  
En	
   la	
   práctica,	
   se	
   evidenció	
   que	
   si	
   no	
   eran	
   utilizadas	
   cuidadosamente,	
   el	
   uso	
  
indiscriminado	
   de	
   estas	
   técnicas	
   podría	
   conducir	
   a	
   un	
   aumento	
   dramático	
   del	
  
número	
  de	
  moléculas	
  o	
  candidatos,	
  de	
  manera	
  que	
  el	
  descubrimiento	
  de	
  un	
  nuevo	
  
fármaco	
  sería	
  como	
  hallar	
  una	
  aguja	
  en	
  un	
  pajar.	
  Mientras	
  que	
  el	
  número	
  de	
   hits	
  
identificados	
   pudo	
   ser	
   incrementado	
   sustancialmente,	
   se	
   observó	
   que	
   no	
   existía	
  
una	
   correspondencia	
   con	
   el	
   crecimiento	
   del	
   número	
   de	
   fármacos	
   que	
   entraban	
   al	
  
mercado,	
   dejando	
   esto	
   claro	
   que	
   el	
   verdadero	
   paso	
   limitante	
   del	
   descubrimiento	
  
de	
   fármacos	
   no	
   era	
   la	
   generación	
   de	
   hits,	
   sino	
   los	
   pasos	
   de	
   identificación	
   y	
  
optimización	
   del	
   compuesto	
   líder	
   (10).	
   Como	
   resultado,	
   este	
   tipo	
   de	
   solución	
   a	
  
gran	
   escala	
   ha	
   sido	
   abandonada	
   progresivamente	
   en	
   los	
   últimos	
   años,	
  
favoreciéndose	
   una	
   racionalización	
   del	
   proceso,	
   en	
   la	
   que	
   los	
   métodos	
  
computacionales	
  han	
  ganado	
  una	
  importancia	
  creciente	
  (10).	
  

2.	
  MÉTODOS	
  COMPUTACIONALES	
  O	
  IN	
  SILICO	
  

        Debido	
   a	
   la	
   necesidad	
   de	
   explotar	
   las	
   cantidades	
   masivas	
   de	
   datos	
  
generados	
   por	
   las	
   tecnologías	
   de	
   alto	
   rendimiento,	
   los	
   métodos	
   computacionales	
  
se	
   han	
   ido	
   implementando	
   de	
   manera	
   creciente	
   en	
   el	
   proceso	
   de	
   descubrimiento	
  
de	
  fármacos	
  (7).	
  Para	
  unificar	
  la	
  combinación	
  de	
  los	
  métodos	
  computacionales	
  y	
  la	
  
Química	
   Medicinal,	
   F.	
   K.	
   Brown	
   acuñó	
   en	
   1998	
   el	
   término	
   “quimioinformática”	
  
definiéndola	
   como:	
   “la	
   combinación	
   de	
   aquellos	
   recursos	
   de	
   información	
   para	
  
transformar	
  datos	
  en	
  información	
  y	
  la	
  información	
  en	
  conocimiento	
  con	
  el	
  propósito	
  
de	
   tomar	
   mejores	
   y	
   más	
   rápidas	
   decisiones	
   en	
   el	
   área	
   de	
   la	
   identificación	
   y	
  
optimización	
   de	
   compuestos	
   líderes”	
   (16).	
   Actualmente,	
   este	
   concepto	
   aparece	
  
definido	
  de	
  una	
  manera	
  más	
  amplia	
  para	
  considerar	
  la	
  quimioinformática	
  como	
  “la	
  
aplicación	
   de	
   métodos	
   informáticos	
   para	
   resolver	
   problemas	
   químicos”	
   (17).	
   Esta	
  
definición	
   general	
   engloba	
   múltiples	
   aspectos	
   como	
   la	
   representación,	
  
almacenamiento,	
   recolección	
   y	
   análisis	
   de	
   la	
   información	
   química	
   en	
   un	
   sistema	
  
informático.	
   Algunos	
   de	
   los	
   frentes	
   de	
   trabajo	
   abiertos	
   en	
   esta	
   área	
   relativamente	
  
joven	
  continúan	
  siendo	
  la	
  minería	
  de	
  textos	
  químicos,	
  los	
  estudios	
  QSAR,	
  el	
  diseño	
  
de	
   fármacos	
   basado	
   en	
   estructura	
   y	
   el	
   diseño	
   de	
   fármacos	
   basado	
   en	
   fragmentos	
  
(18).	
  

                                                                                                                            	
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