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P. 21

Óscar	
  Miguel	
  Rivera	
  Borroto	
  &	
  col.	
  

	
  
aleatoria,	
  además	
  que	
  evitan	
  el	
  malgasto	
  de	
  recursos	
  computacionales	
  y	
  de	
  tiempo	
  
(28).

        Un	
   enfoque	
   más	
   exacto	
   de	
   los	
   métodos	
   de	
   cribado	
   virtual	
   consiste	
   en	
   la	
  
construcción	
  de	
  un	
  modelo	
  que	
  correlacione	
  la	
  estructura	
  de	
  las	
  moléculas	
  con	
  sus	
  
respectivas	
   actividades	
   biológicas	
   a	
   partir	
   de	
   un	
   grupo	
   de	
   moléculas	
   previamente	
  
evaluadas.	
   Este	
   problema	
   se	
   conoce	
   como	
   la	
   modelización	
   de	
   la	
   relación	
  
estructura-­-actividad	
   (REA)	
   más	
   comúnmente	
   conocido	
   por	
   sus	
   siglas	
   en	
   inglés	
  
QSAR,	
   acrónimo	
   de	
   Quantitative	
   Structure-­-Activity	
   Relationship,	
   e	
   involucra	
  
métodos	
   de	
   los	
   campos	
   de	
   la	
   Estadística	
   y	
   el	
   Aprendizaje	
   Automático	
   (29,	
   30).	
   La	
  
utilidad	
   práctica	
   de	
   este	
   enfoque	
   se	
   ha	
   constatado,	
   por	
   ejemplo,	
   en	
   estudios	
   de	
  
identificación	
   de	
   nuevas	
   entidades	
   anti	
   protozoarias	
   (Trichomona	
   vaginalis)	
  
mediante	
   la	
   técnica	
   estadística	
   Análisis	
   Discriminante	
   Lineal	
   usando	
   descriptores	
  
moleculares	
  definidos	
  por	
  el	
  Prof.	
  Dr.	
  Yovani	
  Marrero	
  Ponce	
  (31-­-33).	
  Este	
  enfoque	
  
también	
  se	
  ha	
  aplicado	
  en	
  el	
  descubrimiento	
  de	
  fármacos	
  frente	
  a	
  la	
  enfermedad	
  de	
  
Chagas	
   (34).	
   Algunos	
   de	
   los	
   algoritmos	
   más	
   populares	
   en	
   el	
   área	
   de	
   la	
   minería	
   de	
  
datos	
  pueden	
  estudiarse	
  en	
  (35).	
  

3.	
  GENERALIDADES	
  DE	
  LA	
  SIMILITUD	
  MOLECULAR	
  

        El	
  concepto	
  de	
  similitud	
  ha	
  ganado	
  un	
  espacio	
  cada	
  vez	
  más	
  importante	
  en	
  
la	
   quimioinformática	
   debido	
   fundamentalmente	
   al	
   principio	
   de	
   similitud,	
   el	
   cual	
  
plantea	
   que	
   moléculas	
   con	
   estructuras	
   similares	
   tienden	
   a	
   exhibir	
   propiedades	
  
similares	
   (36).	
   Este	
   principio	
   parece	
   ser	
   una	
   adaptación	
   de	
   un	
   proceso	
   que,	
   según	
  
algunos	
   autores,	
   es	
   el	
   reflejo	
   directo	
   del	
   núcleo	
   del	
   sistema	
   cognitivo	
   humano,	
   el	
  
razonamiento	
   por	
   analogía	
   (37),	
   y	
   ha	
   sido	
   apoyado	
   por	
   un	
   buen	
   número	
   de	
  
resultados	
   experimentales	
   [ver	
   por	
   ejemplo	
   referencia	
   (38)].	
   Sin	
   embargo,	
   otros	
  
hallazgos	
   han	
   sugerido	
   que	
   eventualmente	
   moléculas	
   estructuralmente	
   similares	
  
exhiben	
   comportamientos	
   disimilares,	
   así	
   como	
   moléculas	
   estructuralmente	
  
disimilares	
  exhiben	
  comportamientos	
  similares	
  (39).	
  Para	
  sistematizar	
  este	
  cuerpo	
  
de	
   evidencias	
   algunos	
   autores	
   han	
   propuesto,	
   en	
   el	
   contexto	
   del	
   diseño	
   de	
  
fármacos,	
   un	
   cuadro	
   (matriz	
   de	
   confusión)	
   de	
   cuatro	
   hipótesis	
   bayesianas	
   ,	
   i.e.,	
   i-­-)	
  
moléculas	
   estructuralmente	
   similares	
   es	
   muy	
   plausible	
   que	
   tengan	
   actividades	
  
similares,	
   ii-­-)	
   moléculas	
   estructuralmente	
   similares	
   es	
   plausible	
   que	
   tengan	
  
actividades	
   disimilares,	
   iii-­-)	
   moléculas	
   estructuralmente	
   disimilares	
   es	
   plausible	
   que	
  
tengan	
   actividades	
   similares,	
   iv-­-)	
   moléculas	
   estructuralmente	
   disimilares	
   es	
   muy	
  
plausible	
  que	
  tengan	
  actividades	
  disimilares	
  (40).	
  Las	
  hipótesis	
  i-­-)	
  y	
  iv-­-)	
  conforman	
  
la	
   lógica	
   de	
   base	
   para	
   técnicas	
   como	
   la	
   búsqueda	
   de	
   similitud	
   y	
   los	
   algoritmos	
   de	
  
agrupamiento	
   para	
   la	
   selección	
   de	
   compuestos	
   intra	
   clúster	
   (41,	
   42).	
   La	
   hipótesis	
  
ii-­-)	
  conforma	
  la	
  lógica	
  de	
  base	
  de	
  un	
  grupo	
  de	
  técnicas	
  novedosas	
  para	
  el	
  análisis	
  y	
  
visualización	
   de	
   los	
   acantilados	
   de	
   actividad	
   y	
   una	
   de	
   sus	
   aplicaciones	
   potenciales	
  
es	
   la	
   identificación	
   de	
   pequeños	
   cambios	
   moleculares	
   responsables	
   de	
   un	
   cambio	
  

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