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Molecular modeling methodologies in the design, synthesis and rational explanation of results

En la acilación de diferentes (1,n)-alcanodioles Un diseño estadístico experimental permite conocer los

utilizados como intermedios en la preparación de una gran factores que tienen mayor impacto sobre los resultados.

variedad de compuestos de interés como agentes Usando este método, muchas variables pueden ser

antibacterianos entre otros, se utilizó la lipasa de páncreas estudiadas al mismo tiempo, y utilizando esta información,

porcino mediante la realización de un docking manual de las condiciones experimentales se pueden mejorar hasta

los diferentes sustratos en la estructura descrita del centro llegar a las condiciones óptimas.

activo, para el 2-fenil-1,3-propanodiol (Figura 2A ). Se Todos los métodos estadísticos multivariable tienen la
postuló el posible papel del residuo Phe216 como capacidad de extraer la información relevante contenida en
importante para el correcto reconocimiento del sustrato, un sistema complejo descrito por un amplio número de
ajustando las dimensiones de los sustratos a un triángulo variables (hasta varios miles) y esta información se
cuyas dimensiones coinciden con los residuos Ser153, representa en un espacio de dimensionalidad reducida,
His264 (correspondientes a la tríada catalítica) y la haciendo así posible su interpretación. Los métodos
mencionada Phe 216. Un estudio más refinado de docking estadísticos multivariable están basados en diferentes bases
realizado por nuestro grupo años después ha confirmado matemáticas. En particular los métodos QSAR usan las
dicha hipótesis, al verificarse las distancias previstas y las propiedades estructurales de las moléculas (generalmente
interacciones propuestas (Figura 2B). adquiridas por métodos de simulación) como la base de

Cuando los fenómenos son demasiado complejos para partida para el análisis estadístico, que eventualmente

ser simulados, se usan otros métodos de cálculo, tales encuentra correlaciones entre la estructura molecular y

como la quimiometría, que es la ciencia de las mediciones respuestas medibles experimentalmente.

realizadas sobre un sistema o proceso químico sobre el Debido a su capacidad inherente de simplificar el
estado del sistema por aplicación de métodos matemáticos análisis de sistemas complejos, la quimiometría encuentra
o estadísticos. Consta de una serie de técnicas una amplia aplicación para el estudio y optimización de
heterogéneas, entre las cuales el diseño estadístico de procesos industriales.
experimentos y análisis estadísticos multivariante son los

más importantes para la aplicación en biocatálisis.

Tabla 1A. Métodos computacionales en diseño de fármacos.

Métodos computacionales en diseño de fármacos

directos

Modelización Docking Binding

indirectos

QSAR Farmacóforo Diversidad Molecular

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