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P. 63

NURIA	
  E.	
  CAMPILO	
  y	
  col.	
  

	
  

        Seyler,	
  A.,	
  Sharma,	
  R.,	
  Shetty,	
  J.,	
  Simpson,	
  A.	
  J.,	
  Sisk,	
  E.,	
  Tammi,	
  M.	
  T.,	
  Tarleton,	
  R.,	
  Teixeira,	
  S.,	
  
        Van	
  Aken,	
  S.,	
  Vogt,	
  C.,	
  Ward,	
  P.	
  N.,	
  Wickstead,	
  B.,	
  Wortman,	
  J.,	
  White,	
  O.,	
  Fraser,	
  C.	
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  Stuart,	
  
        K.	
  D.,	
  &	
  Andersson,	
  B.	
  (2005).	
  The	
  genome	
  sequence	
  of	
  Trypanosoma	
  cruzi,	
  etiologic	
  agent	
  of	
  
        Chagas	
  disease.	
  Science	
  309(5733),	
  409-­-415.	
  

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   &	
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   cruzi	
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   Science	
   309(5733),	
  
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  Data	
  Bank.	
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   Computational	
   methods	
   for	
   calculation	
   of	
   ligand-­-
        binding	
  affinity.	
  Curr	
  Drug	
  Targets	
  9(12),	
  1031-­-1039.	
  

83.	
   Dias,	
   R.,	
   &	
   de	
   Azevedo,	
   W.	
   F.,	
   Jr.	
   (2008).	
   Molecular	
   docking	
   algorithms.	
   Curr	
   Drug	
   Targets	
  
        9(12),	
  1040-­-1047.	
  

84.	
   Congreve,	
   M.,	
   Chessari,	
   G.,	
   Tisi,	
   D.,	
   &	
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   A.	
   J.	
   (2008).	
   Recent	
   developments	
   in	
  
        fragment-­-based	
  drug	
  discovery.	
  J	
  Med	
  Chem	
  51(13),	
  3661-­-3680.	
  

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   (2011).	
   Scoring	
   functions	
   and	
   their	
   evaluation	
   methods	
   for	
  
        protein-­-ligand	
   docking:	
   recent	
   advances	
   and	
   future	
   diretions.	
   Phys.	
   Chem.	
   Chem.	
   Phy.	
   12,	
  
        12899-­-12908.	
  

86.	
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  S.,	
  Zhang,	
  Y.,	
  Xin,	
  Z.	
  (2011)	
  Rescoring	
  ligand	
  docking	
  poses.	
  Curr.	
  Opin.	
  Drug.	
  Discov.	
  
        Devel.	
  13,	
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   T.	
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   A	
   geometric	
  
        approach	
  to	
  macromolecule-­-ligand	
  interactions.	
  J	
  Mol	
  Biol	
  161(2),	
  269-­-288.	
  

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        Successful	
   virtual	
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   of	
   a	
   chemical	
   database	
   for	
   farnesyltransferase	
   inhibitor	
   leads.	
   J	
  
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  Chem	
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  (2003).	
  LigandFit:	
  a	
  novel	
  method	
  
        for	
   the	
   shape-­-directed	
   rapid	
   docking	
   of	
   ligands	
   to	
   protein	
   active	
   sites.	
   J	
   Mol	
   Graph	
   Model	
  
        21(4),	
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  (1996).	
  A	
  fast	
  flexible	
  docking	
  method	
  using	
  
        an	
  incremental	
  construction	
  algorithm.	
  J	
  Mol	
  Biol	
  261(3),	
  470-­-489.	
  

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  Taylor,	
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  (1997).	
  Development	
  and	
  validation	
  
        of	
  a	
  genetic	
  algorithm	
  for	
  flexible	
  docking.	
  J	
  Mol	
  Biol	
  267(3),	
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        Automated	
   docking	
   using	
   a	
   Lamarckian	
   genetic	
   algorithm	
   and	
   an	
   empirical	
   binding	
   free	
  
        energy	
  function.	
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   Theoretical	
   and	
   practical	
  
        considerations	
  in	
  virtual	
  screening:	
  a	
  beaten	
  field?	
  Curr	
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  Chem	
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        Interactions	
   at	
   the	
   dimer	
   interface	
   influence	
   the	
   relative	
   efficiencies	
   for	
   purine	
   nucleotide	
  
        synthesis	
   and	
   pyrophosphorolysis	
   in	
   a	
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   J	
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   The	
   role	
   for	
   an	
   invariant	
   aspartic	
   acid	
   in	
  
        hypoxanthine	
   phosphoribosyltransferases	
   is	
   examined	
   using	
   saturation	
   mutagenesis,	
  
        functional	
  analysis,	
  and	
  X-­-ray	
  crystallography.	
  Biochemistry	
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   Focia,	
   P.	
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   R.	
   J.,	
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   A.	
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   A	
   1.4	
   A	
  
        crystal	
   structure	
   for	
   the	
   hypoxanthine	
   phosphoribosyltransferase	
   of	
   Trypanosoma	
   cruzi.	
  
        Biochemistry	
  37(43),	
  15066-­-15075.	
  

60	
  

	
  
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