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ÁLVARO CORTÉS CABRERA Y CRISTINA RUEDA PÉREZ AN. R. ACAD. NAC. FARM.

Keywords: Molecular dynamics; Docking; Glucocorticoids
Receptor; Flavonoids.

RESUMEN

Predicción de la energía de unión y efecto antiinflamatorio
de flavonoides sobre el receptor de glucocorticoides mediante
simulaciones de dinámica molecular y el método linear
de energía de interacción

Los flavonoides son compuestos formados por tres anillos con
varias sustituciones sintetizados en vegetales de los aminoácidos
aromáticos fenilalanina y tirosina para participar en la fase luz-
dependiente de la fotosíntesis transportando electrones. Sus propie-
dades antiinflamatorias son de especial interés debido a que las
reacciones adversas que estos producen en humanos son raras. Por
esta razón, el objetivo del presente trabajo es explicar el modo de
unión de estas moléculas y estimar la energía de unión al receptor
de glucocorticoides utilizando el método LIE. Se utilizaron 15 flavo-
noides para correlacionar sus energías de unión estimadas con las
experimentales. El coeficiente de correlación alcanzado fue signifi-
cativo (R2 = 0,74 y p = 0,000) y se obtuvo una buena descripción del
modelo. Se encontraron tres zonas de unión por puente de hidróge-
no correspondiendo a los aminoácidos Arg81-Gln40, Thr205-Gln111
and Leu33-Asn34. La primera zona se pudo correlacionar con meno-
res valores de energía con una confianza del 95%.

Palabras clave: Dinámica molecular; Docking; Receptor gluco-
corticoides; Flavonoides.

1. INTRODUCTION

Flavonoids are compounds of low molecular weight, derived from
the secondary metabolism of a wide range of plants. Flavonoids are
composed of a three-ring structure with various substitutions and
are formed in plants, from aromatic amino acids phenylalanine and
tyrosine, to participate in the light-depend phase of photosynthesis
catalyzing electron transport. In plants, they are usually found

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