Predicción de la energía de unión y efecto antiinflamatorio de flavonoides sobre el receptor de glucocorticoides mediante simulaciones de dinámica molecular y el método linear de energía de interacción.

Álvaro Cortés Cabrera, Cristina Rueda Pérez

Resumen


Los flavonoides son compuestos formados por tres anillos con varias sustituciones sintetizados en vegetales de los aminoácidos aromáticos fenilalanina y tirosina para participar en la fase luz-dependiente de la fotosíntesis transportando electrones. Sus propiedades antiinflamatorias son de especial interés debido a que las reacciones adversas que estos producen en humanos son raras. Por esta razón, el objetivo del presente trabajo es explicar el modo de unión de estas moléculas y estimar la energía de unión al receptor de glucocorticoides utilizando el método LIE. Se utilizaron 15 flavonoides para correlacionar sus energías de unión estimadas con las experimentales. El coeficiente de correlación alcanzado fue significativo (R2 = 0.74 and p = 0.000) y se obtuvo una buena descripción del modelo. Se encontraron tres zonas de unión por puente de hidrógeno correspondiendo a los aminoácidos Arg81-Gln40, Thr205-Gln111 and Leu33-Asn34. La primera zona, se pudo correlacionar con menores valores de energía con una confianza del 95%

Palabras clave


Dinámica molecular; Docking; Receptor glucocorticoides; Flavonoides

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